Библиографическое описание:
Мониторинг доминирующих кишечных вирусов в сточной воде как возможность повышения эффективности эпидемиологического надзора за вирусными острыми кишечными инфекциями / Т. В. Амвросьева, Н. В. Поклонская, И. В. Бельская, Ю. Б. Колтунова, Ю. А. Шилова // Гепатология и гастроэнтерология. – 2020. – Т. 4, № 2. – С.201-206. – doi: 10.25298/2616-5546-2020-4-2-201-206.
Аннотации:
Введение. Мониторинг кишечных вирусов в сточной воде – новый эпидемиологический подход, позволяющий отследить интенсивность их циркуляции среди людей. Цель исследования – провести и проанализировать параллельные мониторинговые исследования сточных вод и биологического материала пациентов с вирусными острыми кишечными инфекциями (ОКИ) в отношении актуальных их возбудителей, отобранных в разных регионах Республики Беларусь.
Материал и методы. Методом ПЦР в режиме реального времени исследовали 403 образца сточной воды и 381 пробу фекалий от пациентов с ОКИ, отобранных в разных регионах Беларуси.
Результаты. У пациентов с ОКИ чаще всего обнаруживались ротавирусы А (20,4%) и норовирусы 2 геногруппы (10,2%), тогда как аденовирусы F (2,2%), энтеровирусы (0,8%) и норовирусы 1 геногруппы (0,3%) выявлялись довольно редко. В сточных водах доминировали аденовирусы F (25,9%), ротавирусы А (18,4%) и энтеровирусы (13,4%), норовирусы 2 (6,8%) и норовирусы 1 геногрупп детектировались значительно реже (1,5%). Выявлены определенные различия в долевой структуре возбудителей вирусных ОКИ, присутствующих у пациентов и обнаруженных в сточных водах, что указывает на активную скрытую циркуляцию некоторых из них (аденовирусов F и энтеровирусов). В одной из проб сточной воды выявлен коронавирус SARS-CoV-2. Проведенное секвенирование и биоинформационный анализ его нуклеотидной последовательности выявили 100% сходство с последовательностями изолятов, идентифицированных у пациентов с COVID-19.
Выводы. Полученные данные указывают на перспективность исследований по мониторингу кишечных вирусов в сточных водах с целью повышения эффективности эпидемиологического надзора за циркуляцией известных возбудителей ОКИ и выявления новых и вновь появляющихся кишечных патогенов.
Ключевые слова:
кишечные вирусы, ОКИ, лабораторная диагностика, SARS-CoV-2, сточная вода